Tecniche di neuroimaging cerebrale: applicazioni cliniche e di ricerca  

4  

primo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui saranno illustrate le più innovative tecniche di neuroimaging strutturale e funzionale e le loro applicazioni cliniche e di ricerca in ambito neurologico e psichiatrico. In particolare, saranno trattate: 1) le applicazioni di tecniche di neuroimaging avanzato allo studio delle principali patologie neurologiche in rapporto al fenotipo e allo stadio di malattia; 2) lo studio dei correlati neurofunzionali dei diversi domini delle patologie mentali gravi anche in rapporto alle alterazioni della connettività cerebrale.  

Statistica medica - guida all'impostazione e alla interpretazione della Network Analysis  

4  

primo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui saranno fornite le basi sulle possibili applicazioni in medicina della network analysis, una moderna tecnica di analisi che consente lo studio quantitativo dei sistemi complessi e l'interpretazione delle interrelazioni tra variabili, e che può essere applicata a numerosi ambiti della medicina. Verranno illustrate le basi dell'impostazione ed interpretazione di tale analisi in diversi ambiti medici.  

Meccanismi biomolecolari dell'invecchiamento e delle patologie età-correlate  

4  

primo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui saranno illustrate e discusse le più recenti tecniche di valutazione delle modifiche cellulari legate allo stress ossidativo e alle modifiche epigenetiche conseguenti all’invecchiamento e saranno descritte le loro principali applicazioni di ricerca.  

Alimenti con proprietà nutraceutiche e loro effetti sulla salute  

4  

primo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore. Saranno illustrate le recenti acquisizioni nell'ambito della nutraceutica, con particolare approfondimento del ruolo dei nutraceutici nella protezione gastrica e intestinale.  

Terapie innovative in ambito medico-chirurgico  

24  

terzo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore specifico per ciascun curriculum. Saranno illustrati e discussi i più recenti e innovativi approcci terapeutici medici e chirurgici proposti dalla medicina moderna in ciascuno degli ambiti curriculari  

Journal club  

16  

primo anno
secondo anno  

Incontri periodici in piccoli gruppi con un tutor (4 ore ogni 6 mesi per ciascun curriculum) durante i quali è prevista la sintesi e la valutazione critica di articoli della più recente letteratura scientifica in ciascun ambito curriculare.  

Modelli animali traslazionali nelle patologie somatiche e mentali  

8  

primo anno
secondo anno  

Due mini corsi intensivi di 4 ore ciascuno, in cui saranno forniti un aggiornamento e un’analisi critica sui dati più recenti relativi all’applicazione dei modelli animali nella medicina traslazionale in relazione alle patologie attinenti ai diversi curricula.  

Modelli cellulari 2D e 3D per la medicina di precisione  

4  

secondo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore sulle applicazioni di colture cellulari 2D e 3D nella ricerca sulla prevenzione e il trattamento delle malattie nell'ottica della medicina di precisione, con riferimento alle patologie attinenti ai diversi curricula.  

Asse microbiota intestinale/cervello  

4  

secondo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui saranno illustrati i meccanismi alla base dell’influenza bidirezionale tra l’apparato gastro-intestinale e le funzioni del sistema nervoso centrale, con particolare riferimento al ruolo del microbiota intestinale.  

Gli effetti delle tossine uremiche in pazienti con insufficienza renale cronica  

4  

primo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui saranno illustrati gli effetti e i meccanismi d’azione delle tossine uremiche con particolare riferimento al ruolo dei composti solforati tra i fattori di rischio cardiovascolare e agli effetti metabolici ed epigenetici della disfunzione di folati.  

I disturbi del neurosviluppo: dall'infanzia all'età adulta  

4  

primo anno  

Mini-corso intensivo di 4 ore in cui saranno illustrati e discussi i dati più recenti della letteratura sulle associazioni tra specifici aspetti dei disturbi dello spettro autistico nell’infanzia e la compromissione di specifici domini psicopatologici in soggetti adulti con schizofrenia e sull'ipotesi avanzata da numerosi autori che la schizofrenia sia una patologia associata ad alterazioni del neurosviluppo.  

Corso di Statistica Medica con Software R  

16  

primo anno
secondo anno  

METODI STATISTICI PER RIPORTARE INFORMAZIONE BIOMEDICA:
- Quale informazione raccogliere e come
- Variabili statistiche (qualitative, quantitative)
- Principal errori di misurazione: concetti correlati di precisione e accuratezza
- Principali approcci per controllo qualità dei dati
- presentazione di dati: tabelle e grafici
- Sintesi di dati: principali misure di sintesi descrittiva
- Concetti di popolazione, campione sperimentale e unità statistica
PRINCIPALI METODI STATISTICI PER TRARRE CONCLUSIONI DA RISULTATI DELLA RICERCA
- Probabilità e distribuzione di probabilità
- Distribuzione del campione sperimentale
- Concetti di stima parametrica
- Principi di inferenza statistica
- Intervalli di confidenza
- Test ipotesi
- Errori tipo I e tipo II
- Criteri per la scelta del test statistico appropriato
LA FILOSOFIA DEL SOFTWARE R
- Sintassi di base e struttura dei dati
- Import e gestione dei dati
- Sintesi statistiche e grafici
- Inferenza statistica con R  

Le basi genetiche delle malattie complesse  

4  

primo anno
secondo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui saranno illustrate e discusse le più recenti conoscenze sulle complesse interrelazioni tra fattori genetici e ambientali nello studio delle cosiddette malattie complesse.  

Il modello biopsicosociale nelle patologie mediche  

4  

primo anno
secondo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore in cui sarà illustrato l’approccio olistico della medicina moderna secondo cui la malattia e la salute sono il risultato dell’interazione complessa di fattori biologici, psicologici e sociali e sarà discussa l’importanza di tali fattori nella gestione terapeutica del paziente.  

Il concetto di biomarcatore in medicina  

4  

secondo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore. Saranno illustrate le conoscenze più avanzate nell’ambito dei potenziali biomarcatori specifici per le patologie attinenti ciascun curriculum. Sarà fatto particolare riferimento all’individuazione di fattori di rischio nell’ottica della medicina preventiva e degli indici prognostici e di risposta al trattamento nell’ottica della medicina personalizzata.  

Modelli "in silico" e "digital twin"  

4  

primo anno
secondo anno  

Mini corso intensivo di 4 ore. Saranno illustrate le tecnologie più avanzate di simulazione e visualizzazione computerizzata di processi biologici e medici e la loro applicazione con la creazione di modelli computerizzati che consentano di predire un’enorme quantità di dati difficilmente misurabili nel singolo paziente  

Ciclo di Neurowebinars  

20  

primo anno
secondo anno
terzo anno  

Neurowebinars è un’iniziativa interuniversitaria e interdisciplinare, didattica ed editoriale in rete, in cui illustri ricercatori e clinici sono di volta in volta invitati a presentare, nella forma del webinar, un seminario serale, aperto a tutti gli iscritti a corsi di dottorato e specializzazione medica delle Università aderenti. Lo scopo è favorire la diffusione della conoscenza nelle diverse branche delle neuroscienze cliniche e sperimentali e delle discipline limitrofe, promuovendo il confronto e il dialogo tra la scienza e gli altri campi del sapere. I neurowebinars sono disponibili offline nella videoteca consultabile dagli iscritti.  

Valorizzazione e disseminazione dei risultati, della proprietà intellettuale e dell’accesso aperto ai dati e ai prodotti della ricerca  

Open Science: principi di base
Open science e gestione dei dati della ricerca (Open Access, Fair data). L’obiettivo del corso, suddiviso in tre moduli, è fornire indicazioni sul ciclo delle pubblicazioni scientifiche dalla scrittura alla pubblicazione, sulla gestione dei dati di ricerca, su come riconoscere un editore predatorio, su come ricercare letteratura scientifica open, sull'attribuzione di una licenza ai propri contenuti digitali.
Scienza aperta:
- I principi di un accesso ampio e diffuso alla conoscenza scientifica - I diritti e le licenze
Open access :
- Il sistema di produzione e circolazione delle pubblicazioni scientifiche. Le reazioni delle comunità scientifiche
- I preprint, le riviste scientifiche, le piattaforme editoriali, i predatory publishers
Dati FAIR :
- La crisi della riproducibilità
- Perché non gestire i dati costa di più che gestirli
Competenze:
Al termine del corso il dottorando avrà acquisito competenza digitale di base su cosa è l’Open science, sulla gestione etica di pubblicazioni e dati, sulla produzione, validazione, accessibilità di pubblicazioni e dati, sugli strumenti per la ricerca di pubblicazioni e dati open. Pertanto sarà in grado di: articolare i fabbisogni informativi, ricercare i dati, le informazioni e i contenuti in ambienti digitali, accedervi e navigare al loro interno; creare e aggiornare strategie di ricerca personali; gestire dati, informazioni e contenuti digitali.
Il dottorando, tenendo conto anche degli aspetti etici e legati alla sicurezza, avrà ricevuto una formazione sui seguenti contenuti:
corretta gestione dei dati a partire dalla raccolta, documentazione e archiviazione all’accesso, uso e conservazione (o distruzione) dei dati; rispondenza dei dati alle aspettative della Commissione europea e alle politiche sull’Open Scienze (FAIR: Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).  

Seminari  

Il seminario intensivo in scientific writing ha come obiettivo familiarizzare sulla struttura e sulla stesura di articoli scientifici evidenziando come, indipendentemente dalla specifica disciplina scientifica, le pubblicazioni scientifiche mostrino caratteri comuni ed una comune strategia di scrittura. saranno trattati gli aspetti riportati di seguito.
Risultati attesi: comprensione del funzionamento della revisione tra pari e del ruolo dell’editore della rivista scientifica, conoscenza delle sezioni di un articolo e della loro preparazione.
Capacità di stesura di un articolo scientifico che sia completo in tutte le sue parti, strutturato e convincente.
Capacità di valutare i risultati sperimentali nel contesto dello stato dell’arte per la scelta della rivista scientifica, capacità di organizzare i dati per la stesura dell’articolo.
Abilità comunicative: Evidenziare i punti di forza dei risultati di una ricerca, senza omettere quelli di debolezza, discutendoli in un contesto di confronto con la letteratura; capacità di descrizione dello stato dell’arte; capacità di preparazione di materiale grafico di qualità e chiarezza.
Contenuti:
descrizione di cosa si intende per pubblicazione scientifica, metodo scientifico sperimentale, ricerca guidata dalla curiosità o dal problem solving; processo di revisione tra pari, ruolo dell’editore della rivista scientifica descrizioni dei diversi tipi di riviste scientifiche e confronto, impact factor, green, gold e diamond open access; preparazione del titolo, preparazione dell’abstract; affiliazione e lista degli autori, con quale criterio scegliere i coautori di un lavoro scientifico; stesura dell’introduzione, passaggi chiave verso la presentazione dei risultati; risultati e discussione, ordine e criterio; importanza della preparazione di figure, tabelle; conclusioni e prospettive future; preparazione della bibliografia; preparazione della cover letter; preparazione comunicazione formato poster e orale.  

Gestione della ricerca e della conoscenza dei sistemi di ricerca europei e internazionali  

Strumenti di finanziamento, gestione della ricerca e procedure: il corso comune per la Scuola di Dottorato organizzato dall'Ateneo prevede seminari volti alla presentazione delle differenti tipologie di progetti di ricerca nazionali e internazionali (Horizon, Life, Prin, etc.), fondi strutturali (FESR, FEAMP, FEASR, etc.), cluster nazionali, cluster regionali, lettura e interpretazione di un bando, cofinanziamento, illustrazione di esperienze di programmi approvati e finanziati, acquisizione di una aggiornata metodologia finalizzata alla redazione di nuove proposte di ricerca con i rispettivi sistemi di finanziamento.  

Valorizzazione e disseminazione dei risultati, della proprietà intellettuale e dell’accesso aperto ai dati e ai prodotti della ricerca  

Spin Off e Start up della ricerca: concetti introduttivi e presupposti per la nascita di un'impresa; il modello di business e i regolamenti; l'ecosistema di innovazione a supporto delle start up. Sono previsti 3 moduli di 4 ore, comuni a tutti i dottorati. Il corso comune alla Scuola di Dottorato è focalizzato su principi, prassi e strategie di brevettazione nei processi di gestione e valorizzazione dell’attività di ricerca a livello nazionale e internazionale.
Le lezioni hanno lo scopo di trasferire un background teorico sul quale innestare strumenti d’uso pratico, quali: moduli e iter procedurali per strutturare domande di brevetto; tecniche di ricerca in banche dati brevettuali e codici di classificazione; requisiti di brevettabilità di un’invenzione.
Al fine di consentire ai dottorandi di acquisire le competenze necessarie per valorizzare i risultati conseguiti nel proprio percorso di ricerca e della relativa proprietà intellettuale, saranno individuati nuovi contesti e ambiti di applicazione della ricerca industriale, modelli di impresa intelligenti, progetti integrati e soluzioni innovative.
Si avvieranno attività laboratoriali per l’abbinamento-scambio tra i dottorandi appartenenti a settori scientifico disciplinari differenti volti a strutturare nuove proposte di valorizzazione della proprietà intellettuale per simulare la creazione di start up e spin off.  

Perfezionamento informatico  

Corso di Machine Learning e Reti neurali comune alla Scuola di Dottorato in Scienze della Vita.
Introduzione al Machine Learning e intelligenza artificiale.
FONDAMENTI:
- Dati e pattern: numerici, categorici, sequenze.
- Problemi di learning: classificazione, regressione, clustering, riduzione, dimensionalità, representation learning.
- Tipi di Learning: supervisionato, non supervisionato, batch, incrementale, naturale, reinforcement learning.
- Training e valutazione prestazioni: funzione obiettivo, parametri, iperparametri, misura delle prestazioni, training, validation, test, convergenza, generalizzazione e overfitting.
CLASSIFICAZIONE:
- Classificatore di Bayes.
- Nearest neighbor.
- SVM.
- Multi classificatori.
REGRESSIONE:
- Lineare.
- Non Lineare.
CLUSTERING:
- Gerarchico.
- Centroide-based.
RIDUZIONE DIMENSIONALITÀ:
- Principal Component Analysis (PCA).
- Linear Discriminant Analysis (LDA)
RETI NEURALI:
- Neuroni biologici.
- Neuroni artificiali.
- Tipologie di reti.
- Multilayer Perceptron (MLP).
DEEP LEARNING:
- Perché deep? Livelli e complessità, tipologie di DNN.
- Da MLP a CNN.
- Convolutional Neural Networks (CNN).  

Perfezionamento linguistico  

Il corso in lingua inglese è finalizzato all’acquisizione delle competenze fondamentali per la scrittura e la pubblicazione di articoli scientifici in lingua inglese, nonché delle abilità linguistiche necessarie durante la partecipazione interattiva in contesti accademici internazionali (convegni, seminari, ecc.).
Il corso comune alla Scuola di Dottorato si propone anche di fornire conoscenze di alcune “soft skills” quali lavorare in team e sviluppare pensiero critico e flessibilità, che sono requisiti richiesti ai dottorandi nei contesti organizzativi che caratterizzano tanto la comunità accademica quanto il mondo del lavoro. Il Corso di livello intermedio (accesso con livello B1) è di 50 ore, 30 ore con il lecturer + 20 ore di studio autonomo. Il livello avanzato sarà specifico per scientific writing (50 ore: 30 con docente 20 di studio autonomo). Inoltre l’Ateneo, attraverso la piattaforma Rosetta Stone, offre corsi di lingua con scelta tra 24 lingue. In particolare per il livello inferiore di competenza inglese sarà fortemente raccomandata la piattaforma Rosetta Stone fin dal primo anno.  

Gestione della ricerca e della conoscenza dei sistemi di ricerca europei e internazionali  

Corsi organizzati comuni a tutti i dottorandi organizzati dall'Ateneo in collaborazione con l’Agenzia per la Promozione della Ricerca Europea (APRE) dall’Ateneo: 1) Open access & science, è previsto 1 modulo di 2 ore; 2) Dissemination, Communication & Exploitation: come massimizzare i risultati, è previsto 1 modulo di 2 ore; 3) Possibili percorsi formativi post PhD, è previsto 1 modulo di 2 ore.  

Seminari  

La valutazione della ricerca: gli indicatori bibliometrici (IF, citation index e H-index). Il web e la medicina: strumenti e risorse 2.0. Confronto tra Pubmed ed altre banche dati. Saranno analizzate le maggiori banche dati per il settore biomedico e sugli strumenti per la ricerca. I dottorandi saranno introdotti ai servizi delle
risorse della biblioteca di Ateneo. Esercitazioni con Scival e Research Professional.
Focus su WoS e JCR di Clarivate. Focus su Scopus e Scopus Journal List di Elsevier.  

Principi fondamentali di etica, uguaglianza di genere e integrità  

L'Ateneo, in collaborazione con con l’Agenzia per la Promozione della Ricerca Europea (APRE), organizza percorsi informativi sui bandi Horizon Europe. Sono presenti moduli su Etica in Horizon e Europe Gender in Horizon Europe.
Il dottorandi e le dottorande saranno stimolati alla riflessione sull'orientamento (al genere) della ricerca e il ruolo nei programmi di finanziamento europeo. Sono previsti due moduli di 4 ore (totale 8 ore) comuni a tutti i dottorati.  

Seminari  

"Big data" e banche dati nazionali e internazionali: cloud computing e parallel computing. E' previsto un modulo 4 ore comune su concetti introduttivi e uno di 4 ore specifico per curriculum (per la specificità delle banche dati disponibili o da creare)  

Attività di laboratorio  

Sono previste attività di laboratorio e di ricerca applicata per l’apprendimento delle metodologie di base e delle tecniche di laboratorio specifiche per i diversi curricula. Tra queste, sono inclusi i seguenti settori: biochimica, biologia molecolare, genetica, imaging (elettrofisiologia, risonanza magnetica nucleare strutturale e funzionale), neuropsicologia, colture cellulari.